Коронавирус представляет собой разновидность вируса с оболочкой и геномом линейной одноцепочечной положительной РНК. Его диаметр составляет около 80-120нм. В настоящее время он поражает только позвоночных, таких как человек, мышь, свинья, кошка, собака и домашняя птица. Новый коронавирус COVID-19 был идентифицирован как новый вариант, который может вызывать вирусную пневмонию, легкую лихорадку, сухой кашель, затрудненное дыхание и даже шок.
В наборе для обнаружения нуклеиновых кислот нового коронавируса (COVID-19) (метод зонда QPCR), разработанном RXC, была разработана конструкция с двойной мишенью на основе ORF 1ab (ген RDRP) нового коронавируса и специфической консервативной последовательности, кодирующей ген N нуклеокапсидный белок. Используя одностадийную полимеразную цепную реакцию с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) в сочетании с технологией зонда гидролиза TaqMan, образец РНК обнаруживали по изменению сигнала флуоресценции на приборе количественной ПЦР флуоресценции.
Система обнаружения ПЦР включает праймеры и зонды для генов внутреннего стандарта. Процесс сбора и экстракции образцов контролируется путем определения нормального внутреннего стандарта во избежание ложноотрицательных результатов.
Набор для обнаружения нуклеиновых кислот нового коронавируса (COVID-19) (метод цифровой ПЦР), разработанный биологией Rui Xun, использовал технологию капельной цифровой ПЦР в сочетании с технологией флуоресцентного зонда Taqman для проведения качественного обнаружения нового коронавируса.
Образцы были случайным образом распределены по десяткам тысяч капель масла, полученных с помощью цифрового ПЦР-чипа. Каплю реагировали с помощью ПЦР. После завершения реакции ПЦР считывали сигналы флуоресценции каждой капли и использовали принцип распределения Пуассона для статистики и анализа, чтобы добиться точного обнаружения копий специфического гена нового коронавируса (COVID-19).
Среди них зонд для обнаружения ORF 1ab covid-19 был помечен флуоресценцией FAM, зонд для обнаружения гена N был помечен флуоресценцией hex, а внутренний стандарт был помечен флуоресценцией Cy5.